Od prvog slučaja zaraze koronavirusom, u prosincu 2019. godine, pandemijska se bolest proširila na milijune ljudi diljem svijeta.Ova globalna pandemija romanateški akutni respiratorni sindrom koronavirus 2 (SARS-CoV-2)je jedna od najuvjerljivijih i najzabrinjavajućih globalnih zdravstvenih kriza modernog doba, koja predstavlja veliku prijetnju svijetu i utječe na sve aspekte ljudskog života.[1]
Koronavirusi su jednolančani RNA virusi pozitivnog smisla s ovojnicom iz obitelji Coronaviridae, koji imaju širok spektar domaćina kao što su ljudi, šišmiši, deve i vrste ptica, uključujući stoku i kućne ljubimce, što predstavlja prijetnju javnom zdravlju. 1 Koronavirusi su klasificirani u potporodicu Orthocoronavirinae, koja se dalje dijeli u četiri roda, na temelju razlika u sekvencama proteina: a-koronavirus, b-koronavirus, g-koronavirus i d-koronavirus.A-koronavirusi i b-koronavirusi inficiraju samo sisavce, dok g-koronavirusi i d-koronavirusi prvenstveno inficiraju ptice, iako neki od njih mogu inficirati i sisavce.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV i SARS-CoV-2 sedam su koronavirusa za koje je utvrđeno da zaraze ljude.Među njima su SARSCoV i MERS-CoV, koji su se u ljudskoj populaciji pojavili 2002. i 2012. godine, visoko patogeni.Dok sojevi ljudskog koronavirusa (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 ili HCoV-HKU1 koji kruže u ljudskoj populaciji uzrokuju samo običnu prehladu,7 teški akutni respiratorni sindrom koronavirus 2 (SARS-CoV2), uzročnik COVID-19, novi je B-koronavirus, koji se rano pojavio krajem 2019. godine i rezultirao je razornim smrtnim slučajevima.Primarni simptomi odCOVID 19slični su onima kod SARS-CoV i MERS-CoV: groznica, umor, suhi kašalj, bol u gornjem dijelu prsnog koša, ponekad proljev i dispneja.Za razliku od prošlostiinfekcije koronavirusom (CoV)., brza globalna diseminacija, visoka stopa prijenosa, dulje vrijeme inkubacije, više asimptomatskih infekcija i ozbiljnost bolesti SARS-CoV-2 zahtijevaju dubinsko znanje o strategijama virusne imunološke evazije.
Kao i drugi ljudski koronavirusi (SARS-CoV-2, MERS-CoV), SARSCoV-2 također ima jednolančani RNA genom veličine oko 30 kb.Kao što je prikazano na slici 1, proteini virusne nukleokapside (N) povezuju genom u veliki kompleks ribonukleoproteina (RNP), koji je zatim obavijen lipidima i virusnim proteinima S (šiljak), M (membrana) i E (omotnica).50. kraj genoma ima dva velika otvorena okvira čitanja (ORF), ORF1a i ORF1b, koji kodiraju polipeptide pp1a i pp1b, koji se proizvode u 16 nestrukturnih proteina (NSP) koji uključuju svaki aspekt replikacije virusa pomoću virusnih proteaza NSP3 i NSP5 koje sadrže domenu proteaze sličnu papainu i domenu proteaze sličnu 3C.9 30 kraj genoma kodira strukturne proteine i pomoćne proteine, od kojih je dokazano da su ORF3a, ORF6, ORF7a i ORF7b uključeni virusni strukturni proteini u formiranju virusnih čestica, a ORF3b i ORF6 djeluju kao antagonisti interferona.Prema trenutnoj napomeni na temelju sličnosti sekvenci s drugim B-koronavirusima, SARS-CoV-2 uključuje predviđanja šest pomoćnih proteina (3a, 6, 7a, 7b, 8 i 10).Međutim, nisu svi ti ORF-ovi još uvijek eksperimentalno potvrđeni, a točan broj pomoćnih gena SARS-CoV-2 još uvijek je sporna točka.Stoga je još uvijek nejasno koji pomoćni geni su zapravo izraženi ovim kompaktnim genomom.[2]
Visoko osjetljivi i specifični testovi ključni su za identifikaciju i liječenje pacijenata s COVID-19, kao i za provedbu kontrolnih mjera za ograničavanje izbijanja.Molekularni testovi na mjestu skrbi (POC) imaju potencijal omogućiti ranije otkrivanje i2 izolaciju potvrđenih slučajeva SARS-CoV-2, u usporedbi s laboratorijskim dijagnostičkim metodama, čime se smanjuje prijenos u kućanstvu i zajednici.
[1]Klinički i operativni učinak brzog otkrivanja SARS-CoV-2 na mjestu skrbi u hitnoj službi
[2] Bitka između domaćina i SARS-CoV-2: Urođeni imunitet i strategije izbjegavanja virusa
Vrijeme objave: 25. svibnja 2022